Avez-vous déjà entendu parler d’une planète composée de mondes issus de vos rêves où vous pouvez y vivre une aventure épique ? Bienvenue sur Nintendo World ! NW fut le théâtre de nombreux combats où héros et démons s’affrontèrent durant des siècles. Fatigué de ses blessures, le monde en vint à se fissurer. Ses occupants furent sauvés et se réveillèrent dans le futur à l’intérieur de la « Pandorica », une mystérieuse boîte fabriquée par les « Anciens ». Ils étaient désormais sur un ilôt recomposé où natifs et « aliens » régnaient sur le monde : Next Wave.
Après moults péripéties, ces aventuriers réussirent à remonter le temps, de retour à une période non technologique, grâce au pouvoir du Pokémon sacré Celebi, jusqu’au moment crucial de la destruction de NW. Le Parasite s’est cependant infiltré lors de ce déplacement temporel et il est bien décidé à contaminer les mondes !
Le Parasite s’est replié au plus profond de la planète, protégé par un bouclier impénétrable. Des failles apparaissent désormais sur la planète et dans l’univers et c’est à vous qu’il convient de les refermer pour échapper de nouveau à la destruction du monde.
À présent...Qu’allez-vous faire ? C’est à vous d’en décider !